Protein–RNA interactions for Protein: Q12221

PUF2, mRNA-binding protein PUF2, yeastyeast

Known RBP RIP-Chip data

Length 1,075 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUF2Q12221 YPS1YLR120C 1710 nt12.91□□□□□ -0.34 RIP-Chip
PUF2Q12221 MOT3YMR070W 1473 nt12.37□□□□□ -0.43 RIP-Chip
PUF2Q12221 LPX1YOR084W 1164 nt12.3□□□□□ -0.44 RIP-Chip
PUF2Q12221 FPS1YLL043W 2010 nt12.2□□□□□ -0.46 RIP-Chip
PUF2Q12221 BDF1YLR399C 2061 nt11.81□□□□□ -0.52 RIP-Chip
PUF2Q12221 YKL030WYKL030W 606 nt11.61□□□□□ -0.55 RIP-Chip
PUF2Q12221 TIM23YNR017W 669 nt11.51□□□□□ -0.57 RIP-Chip
PUF2Q12221 GUT2YIL155C 1950 nt11.45□□□□□ -0.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 YLL053CYLL053C 459 nt11.45□□□□□ -0.58 RIP-Chip
PUF2Q12221 FTR1YER145C 1215 nt11.36□□□□□ -0.59 RIP-Chip
PUF2Q12221 STB1YNL309W 1263 nt11.22□□□□□ -0.61 RIP-Chip
PUF2Q12221 DDR2YOL052C-A 186 nt11.2□□□□□ -0.62 RIP-Chip
PUF2Q12221 YSP3YOR003W 1437 nt11.1□□□□□ -0.63 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL115CYNL115C 1935 nt11.05□□□□□ -0.64 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPT8YLR055C 1809 nt10.92□□□□□ -0.66 RIP-Chip
PUF2Q12221 DUT1YBR252W 444 nt10.67□□□□□ -0.7 RIP-Chip
PUF2Q12221 DAT1YML113W 747 nt10.65□□□□□ -0.7 RIP-Chip
PUF2Q12221 RBG1YAL036C 1110 nt10.41□□□□□ -0.74 RIP-Chip
PUF2Q12221 POM34YLR018C 900 nt10.24□□□□□ -0.77 RIP-Chip
PUF2Q12221 DIF1YLR437C 402 nt9.98□□□□□ -0.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 RAD23YEL037C 1197 nt9.97□□□□□ -0.81 RIP-Chip
PUF2Q12221 FIT3YOR383C 615 nt9.92□□□□□ -0.82 RIP-Chip
PUF2Q12221 SAM1YLR180W 1149 nt9.88□□□□□ -0.83 RIP-Chip
PUF2Q12221 SED1YDR077W 1017 nt9.76□□□□□ -0.85 RIP-Chip
PUF2Q12221 APT2YDR441C 546 nt9.69□□□□□ -0.86 RIP-Chip
PUF2Q12221 ALG12YNR030W 1656 nt9.67□□□□□ -0.86 RIP-Chip
PUF2Q12221 PRY1YJL079C 900 nt9.63□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR103CYMR103C 363 nt9.61□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 TOA2YKL058W 369 nt9.59□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 STE4YOR212W 1272 nt9.59□□□□□ -0.87 RIP-Chip
PUF2Q12221 MCH5YOR306C 1566 nt9.47□□□□□ -0.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 ADH7YCR105W 1086 nt9.47□□□□□ -0.89 RIP-Chip
PUF2Q12221 RIB7YBR153W 735 nt9.28□□□□□ -0.92 RIP-Chip
PUF2Q12221 THI72YOR192C 1800 nt9.24□□□□□ -0.93 RIP-Chip
PUF2Q12221 INA1YLR413W 2028 nt9.17□□□□□ -0.94 RIP-Chip
PUF2Q12221 FRE6YLL051C 2139 nt9.13□□□□□ -0.95 RIP-Chip
PUF2Q12221 SPT20YOL148C 1815 nt9.02□□□□□ -0.97 RIP-Chip
PUF2Q12221 TVP23YDR084C 600 nt8.92□□□□□ -0.98 RIP-Chip
PUF2Q12221 DIG1YPL049C 1359 nt8.87□□□□□ -0.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 HOL1YNR055C 1761 nt8.86□□□□□ -0.99 RIP-Chip
PUF2Q12221 THP3YPR045C 1413 nt8.79□□□□□ -1 RIP-Chip
PUF2Q12221 SFL1YOR140W 2301 nt8.77□□□□□ -1.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 HEL2YDR266C 1920 nt8.76□□□□□ -1.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 ZAP1YJL056C 2643 nt8.75□□□□□ -1.01 RIP-Chip
PUF2Q12221 SFP1YLR403W 2052 nt8.69□□□□□ -1.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 NPP1YCR026C 2229 nt8.68□□□□□ -1.02 RIP-Chip
PUF2Q12221 REX2YLR059C 810 nt8.61□□□□□ -1.03 RIP-Chip
PUF2Q12221 SRP102YKL154W 735 nt8.51□□□□□ -1.05 RIP-Chip
PUF2Q12221 YMR209CYMR209C 1374 nt8.43□□□□□ -1.06 RIP-Chip
PUF2Q12221 POP2YNR052C 1302 nt8.37□□□□□ -1.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 MAE1YKL029C 2010 nt8.37□□□□□ -1.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 RCR1YBR005W 642 nt8.34□□□□□ -1.07 RIP-Chip
PUF2Q12221 GTB1YDR221W 2109 nt8.32□□□□□ -1.08 RIP-Chip
PUF2Q12221 LSP1YPL004C 1026 nt8.32□□□□□ -1.08 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPS6AYPL090C 711 nt8.19□□□□□ -1.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 AAT1YKL106W 1356 nt8.16□□□□□ -1.1 RIP-Chip
PUF2Q12221 MAS1YLR163C 1389 nt8.07□□□□□ -1.12 RIP-Chip
PUF2Q12221 HXT11YOL156W 1704 nt8□□□□□ -1.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 NBA1YOL070C 1506 nt7.98□□□□□ -1.13 RIP-Chip
PUF2Q12221 DIP5YPL265W 1827 nt7.96□□□□□ -1.14 RIP-Chip
PUF2Q12221 PET494YNR045W 1470 nt7.89□□□□□ -1.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 MRN1YPL184C 1839 nt7.85□□□□□ -1.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 PNS1YOR161C 1620 nt7.84□□□□□ -1.15 RIP-Chip
PUF2Q12221 CPT1YNL130C 1182 nt7.81□□□□□ -1.16 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGR139WYGR139W 339 nt7.8□□□□□ -1.16 RIP-Chip
PUF2Q12221 YGR137WYGR137W 375 nt7.79□□□□□ -1.16 RIP-Chip
PUF2Q12221 INM1YHR046C 888 nt7.78□□□□□ -1.16 RIP-Chip
PUF2Q12221 MNN9YPL050C 1188 nt7.75□□□□□ -1.17 RIP-Chip
PUF2Q12221 ORT1YOR130C 879 nt7.73□□□□□ -1.17 RIP-Chip
PUF2Q12221 TPO1YLL028W 1761 nt7.68□□□□□ -1.18 RIP-Chip
PUF2Q12221 NMA2YGR010W 1188 nt7.64□□□□□ -1.19 RIP-Chip
PUF2Q12221 MDL2YPL270W 2322 nt7.49□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 PIL1YGR086C 1020 nt7.47□□□□□ -1.21 RIP-Chip
PUF2Q12221 SNU66YOR308C 1764 nt7.36□□□□□ -1.23 RIP-Chip
PUF2Q12221 SNF7YLR025W 723 nt7.35□□□□□ -1.23 RIP-Chip
PUF2Q12221 ERG24YNL280C 1317 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF2Q12221 RTC2YBR147W 891 nt7.28□□□□□ -1.24 RIP-Chip
PUF2Q12221 LGE1YPL055C 999 nt7.27□□□□□ -1.25 RIP-Chip
PUF2Q12221 PLB3YOL011W 2061 nt7.19□□□□□ -1.26 RIP-Chip
PUF2Q12221 YNL190WYNL190W 615 nt7.16□□□□□ -1.26 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPL43AYPR043W 279 nt7.13□□□□□ -1.27 RIP-Chip
PUF2Q12221 PMA2YPL036W 2844 nt7.09□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 MGM101YJR144W 810 nt7.05□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 FCY22YER060W-A 1593 nt7.04□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 AIM34YMR003W 597 nt7.03□□□□□ -1.28 RIP-Chip
PUF2Q12221 ENB1YOL158C 1821 nt7.01□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 NUP49YGL172W 1419 nt7.01□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 CRH1YGR189C 1524 nt7□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 MSC3YLR219W 2187 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 PMP3YDR276C 168 nt6.99□□□□□ -1.29 RIP-Chip
PUF2Q12221 RPL31BYLR406C 342 nt6.95□□□□□ -1.3 RIP-Chip
PUF2Q12221 CMK2YOL016C 1344 nt6.86□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF2Q12221 TRS31YDR472W 852 nt6.85□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF2Q12221 SNT309YPR101W 528 nt6.85□□□□□ -1.31 RIP-Chip
PUF2Q12221 AMN1YBR158W 1650 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF2Q12221 ATP10YLR393W 840 nt6.81□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF2Q12221 YTH1YPR107C 627 nt6.8□□□□□ -1.32 RIP-Chip
PUF2Q12221 YCR061WYCR061W 1896 nt6.75□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF2Q12221 AQR1YNL065W 1761 nt6.72□□□□□ -1.33 RIP-Chip
PUF2Q12221 VMA3YEL027W 483 nt6.65□□□□□ -1.34 RIP-Chip
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