RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeastyeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRX1YBL064C FAP1P53971 965 aa13.28□□□□□ -0.28
PRX1YBL064C MTC1P47018 478 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
PRX1YBL064C PRY3P47033 881 aa12.53□□□□□ -0.4
PRX1YBL064C AAD16Q02895 342 aa11.74□□□□□ -0.53
PRX1YBL064C YCK3P39962 524 aa11.73□□□□□ -0.53
PRX1YBL064C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PRX1YBL064C PRI1P10363 409 aa11.6□□□□□ -0.55
PRX1YBL064C DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PRX1YBL064C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
PRX1YBL064C ISW2Q08773 1120 aa10.9□□□□□ -0.66
PRX1YBL064C RPG1P38249 964 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PRX1YBL064C MRPL32P25348 183 aa10.48□□□□□ -0.73
PRX1YBL064C YGL015CP33199 130 aa10.48□□□□□ -0.73
PRX1YBL064C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
PRX1YBL064C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PRX1YBL064C TFA1P36100 482 aa9.88□□□□□ -0.83
PRX1YBL064C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PRX1YBL064C SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PRX1YBL064C REB1P21538 810 aa9.66□□□□□ -0.86
PRX1YBL064C CDC27P38042 758 aa9.66□□□□□ -0.86
PRX1YBL064C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PRX1YBL064C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRX1YBL064C MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRX1YBL064C AVT3P36062 692 aa9.55□□□□□ -0.88
PRX1YBL064C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRX1YBL064C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
PRX1YBL064C UBP9P39967 754 aa9.41□□□□□ -0.9
PRX1YBL064C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
PRX1YBL064C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
PRX1YBL064C TGL3P40308 642 aa9.19□□□□□ -0.94
PRX1YBL064C DCD1P06773 312 aa9.11□□□□□ -0.95
PRX1YBL064C HOP09932 586 aa9.09□□□□□ -0.95
PRX1YBL064C SCY1P53009 804 aa9.09□□□□□ -0.95
PRX1YBL064C TFC8Q12308 588 aa9.06□□□□□ -0.96
PRX1YBL064C SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
PRX1YBL064C SPT21P35209 758 aa8.97□□□□□ -0.97
PRX1YBL064C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
PRX1YBL064C YBL029C-AQ3E756 94 aa8.76□□□□□ -1.01
PRX1YBL064C BCH2P36122 765 aa8.71□□□□□ -1.02
PRX1YBL064C MST1P07236 462 aa8.6□□□□□ -1.03
PRX1YBL064C VNX1P42839 908 aa8.57□□□□□ -1.04
PRX1YBL064C YJL171CP46992 396 aa8.53□□□□□ -1.04
PRX1YBL064C YOR238WQ08634 303 aa8.52□□□□□ -1.05
PRX1YBL064C SPP1Q03012 353 aa8.51□□□□□ -1.05
PRX1YBL064C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PRX1YBL064C BDF1P35817 686 aa8.39□□□□□ -1.07
PRX1YBL064C FKH1P40466 484 aa8.39□□□□□ -1.07
PRX1YBL064C WSC3Q12215 556 aa8.39□□□□□ -1.07
PRX1YBL064C EPS1P40557 701 aa8.38□□□□□ -1.07
PRX1YBL064C DMA1P38823 416 aa8.33□□□□□ -1.08
PRX1YBL064C RIM101P33400 625 aa8.32□□□□□ -1.08
PRX1YBL064C TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
PRX1YBL064C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.27□□□□□ -1.09not detected
PRX1YBL064C BMT6Q12291 365 aa8.26□□□□□ -1.09
PRX1YBL064C PTP3P40048 928 aa8.25□□□□□ -1.09
PRX1YBL064C YAP5P40574 245 aa8.23□□□□□ -1.09
PRX1YBL064C LDB19Q12502 818 aa8.2□□□□□ -1.1
PRX1YBL064C GTT3P39996 337 aa8.13□□□□□ -1.11
PRX1YBL064C ULI1P43604 169 aa8.1□□□□□ -1.11
PRX1YBL064C IOC2Q12072 812 aa8.08□□□□□ -1.12
PRX1YBL064C SSP1P38871 571 aa8.07□□□□□ -1.12
PRX1YBL064C TAF7Q05021 590 aa8.02□□□□□ -1.13
PRX1YBL064C OXP1P28273 1286 aa7.99□□□□□ -1.13
PRX1YBL064C BBC1P47068 1157 aa7.96□□□□□ -1.14
PRX1YBL064C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP7.92□□□□□ -1.14
PRX1YBL064C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
PRX1YBL064C RTG1P32607 177 aa7.9□□□□□ -1.14
PRX1YBL064C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data7.9□□□□□ -1.14not detected
PRX1YBL064C NCR1Q12200 1170 aa7.88□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C LEO1P38439 464 aa7.86□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C PIB1Q06651 286 aa7.86□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C AI2P03876 854 aa7.84□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C YLR271WQ06152 274 aa7.84□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C MSB4Q12317 492 aa7.84□□□□□ -1.15
PRX1YBL064C BCK2P33306 851 aa7.81□□□□□ -1.16
PRX1YBL064C TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PRX1YBL064C RSM7P47150 247 aa7.78□□□□□ -1.16
PRX1YBL064C RGA2Q06407 1009 aa7.76□□□□□ -1.17
PRX1YBL064C SEC61P32915 480 aa7.75□□□□□ -1.17
PRX1YBL064C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PRX1YBL064C MGA2P40578 1113 aa7.73□□□□□ -1.17
PRX1YBL064C SET4P42948 560 aa7.73□□□□□ -1.17
PRX1YBL064C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
PRX1YBL064C YOL036WQ08206 761 aa7.71□□□□□ -1.18
PRX1YBL064C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
PRX1YBL064C LEU3P08638 886 aa7.67□□□□□ -1.18
PRX1YBL064C SAP30P38429 201 aa7.66□□□□□ -1.18
PRX1YBL064C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.64□□□□□ -1.19
PRX1YBL064C CST9Q06032 482 aa7.63□□□□□ -1.19
PRX1YBL064C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PRX1YBL064C PRE3P38624 215 aa7.56□□□□□ -1.2
PRX1YBL064C YDL129WQ07555 291 aa7.52□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C XDJ1P39102 459 aa7.51□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C DAN4P47179 1161 aa7.5□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C MRM1P25270 412 aa7.48□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C VRP1P37370 817 aa7.48□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C DPS1P04802 557 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C RGA1P39083 1007 aa7.47□□□□□ -1.21
PRX1YBL064C JIP4Q03361 876 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.7 ms