Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CA4P22748 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CA4P22748 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CA4P22748 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CA4P22748 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CA4P22748 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CA4P22748 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CA4P22748 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CA4P22748 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CA4P22748 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CA4P22748 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CA4P22748 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms