Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
DTX4Q9Y2E6 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms