Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMC2Q9NRP2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMC2Q9NRP2 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
CMC2Q9NRP2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
CMC2Q9NRP2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CMC2Q9NRP2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMC2Q9NRP2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMC2Q9NRP2 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
CMC2Q9NRP2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms