Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
IL1RAPQ9NPH3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IL1RAPQ9NPH3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms