Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SYNE4Q8N205 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SYNE4Q8N205 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms