Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
WDR53Q7Z5U6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
WDR53Q7Z5U6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms