Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SS18Q15532 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SS18Q15532 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SS18Q15532 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SS18Q15532 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SS18Q15532 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SS18Q15532 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SS18Q15532 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SS18Q15532 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms