Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP3P12645 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP3P12645 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP3P12645 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP3P12645 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP3P12645 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BMP3P12645 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BMP3P12645 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BMP3P12645 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP3P12645 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP3P12645 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BMP3P12645 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP3P12645 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BMP3P12645 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP3P12645 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP3P12645 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP3P12645 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.6 ms