Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
VPREB3Q9UKI3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
VPREB3Q9UKI3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms