Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT2

UBA2, SUMO-activating enzyme subunit 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA2Q9UBT2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UBA2Q9UBT2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
UBA2Q9UBT2 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms