Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA3CQ99985 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMA3CQ99985 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.2 ms