Protein–RNA interactions for Protein: Q12417

PRP46, Pre-mRNA-splicing factor PRP46, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PRP46Q12417 GTF1YGR102C 552 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 FLD1YLR404W 858 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 CDC73YLR418C 1182 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YNR068CYNR068C 819 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 DDP1YOR163W 567 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YOR186WYOR186W 435 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 TCB3YML072C 4638 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YNR065CYNR065C 3351 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 CHL1YPL008W 2586 nt3.55□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 VPS73YGL104C 1461 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 VID28YIL017C 2766 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YCR085WYCR085W 354 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YDR230WYDR230W 348 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YDR282CYDR282C 1245 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 SPC24YMR117C 642 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 ASI2YNL159C 870 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YOL050CYOL050C 321 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YPL162CYPL162C 822 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YPK9YOR291W 4419 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 TDA3YHR009C 1572 nt3.54□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 SSL1YLR005W 1386 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YBR225WYBR225W 2703 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 RAD1YPL022W 3303 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 SUP56tL(CAA)A 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 SUP53tL(CAA)C 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 SUP54tL(CAA)G2 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 ERV29YGR284C 933 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YLR156WYLR156W 345 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YLR159WYLR159W 345 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YLR161WYLR161W 345 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 CDA2YLR308W 939 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 TAF6YGL112C 1551 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 AIP1YMR092C 1848 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 VID27YNL212W 2349 nt3.53□□□□□ -1.84
PRP46Q12417 YKL050CYKL050C 2769 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 TPA1YER049W 1935 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 UBP12YJL197W 3765 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YGL118CYGL118C 438 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 BIO2YGR286C 1128 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 HIS6YIL020C 786 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 ARC15YIL062C 465 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YLR049CYLR049C 1287 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YLR225CYLR225C 1224 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 SHE1YBL031W 1017 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YBL059WYBL059W 582 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 PPQ1YPL179W 1650 nt3.52□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 USA1YML029W 2517 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 ROD1YOR018W 2514 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 TAF7YMR227C 1773 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YBR238CYBR238C 2196 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RPS18AYDR450W 441 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 REE1YJL217W 597 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 SSO2YMR183C 888 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 SIW14YNL032W 846 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 MCK1YNL307C 1128 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 UTP25YIL091C 2166 nt3.51□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 SRP72YPL210C 1923 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 CLB5YPR120C 1308 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 ERB1YMR049C 2424 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RAD7YJR052W 1698 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RPS13YDR064W 456 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 TMC1YOR052C 453 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 VPS28YPL065W 729 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 PIM1YBL022C 3402 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YPK3YBR028C 1578 nt3.5□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 IES6YEL044W 501 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 HAT2YEL056W 1206 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RPS0AYGR214W 759 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 COX2Q0250 756 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YUH1YJR099W 711 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 MSA2YKR077W 1092 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 YBL036CYBL036C 774 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 FUN12YAL035W 3009 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 PGS1YCL004W 1566 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 VHS3YOR054C 2025 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 PMS1YNL082W 2622 nt3.49□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 PAF1YBR279W 1338 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 ACE2YLR131C 2313 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 NRP1YDL167C 2160 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 ARO80YDR421W 2853 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 IMH1YLR309C 2736 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RTS1YOR014W 2274 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RPS11AYDR025W 471 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RPC11YDR045C 333 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 EDC1YGL222C 528 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 RTA1YGR213C 954 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 DPH1YIL103W 1278 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 ADD66YKL206C 804 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 MED7YOL135C 669 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 BMT2YBR141C 1014 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 snR34snR34 203 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 SSU1YPL092W 1377 nt3.48□□□□□ -1.85
PRP46Q12417 SPT16YGL207W 3108 nt3.48□□□□□ -1.85
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