Protein–RNA interactions for Protein: P35244

RPA3, Replication protein A 14 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA3P35244 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPA3P35244 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
RPA3P35244 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPA3P35244 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPA3P35244 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA3P35244 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA3P35244 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA3P35244 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA3P35244 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPA3P35244 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPA3P35244 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPA3P35244 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms