Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FOXD3Q9UJU5 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FOXD3Q9UJU5 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms