Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
RABGEF1Q9UJ41 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RABGEF1Q9UJ41 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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