Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCN11AQ9UI33 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN11AQ9UI33 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms