Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DPM3Q9P2X0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DPM3Q9P2X0 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms