Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDB6

DTX3L, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3LQ8TDB6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DTX3LQ8TDB6 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DTX3LQ8TDB6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms