Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUF8

RIOX2, Ribosomal oxygenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOX2Q8IUF8 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RIOX2Q8IUF8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RIOX2Q8IUF8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms