Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GTF2IP78347 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GTF2IP78347 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GTF2IP78347 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 294.4 ms