Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
USP11P51784 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP11P51784 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP11P51784 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP11P51784 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP11P51784 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP11P51784 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
USP11P51784 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
USP11P51784 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
USP11P51784 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP11P51784 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
USP11P51784 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
USP11P51784 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
USP11P51784 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
USP11P51784 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
USP11P51784 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP11P51784 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP11P51784 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP11P51784 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
USP11P51784 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP11P51784 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP11P51784 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP11P51784 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP11P51784 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
USP11P51784 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
USP11P51784 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms