Protein–RNA interactions for Protein: A6NCN2

KRT87P, Putative keratin-87 protein, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT87PA6NCN2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
KRT87PA6NCN2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KRT87PA6NCN2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms