Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SAMD8Q96LT4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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SAMD8Q96LT4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
SAMD8Q96LT4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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