Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC34Q96HJ3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC34Q96HJ3 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC34Q96HJ3 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms