Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N3U1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N3U1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N3U1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N3U1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Q8N3U1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Q8N3U1 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q8N3U1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Q8N3U1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8N3U1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8N3U1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Q8N3U1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8N3U1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q8N3U1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q8N3U1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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