Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIZ9

TRAT1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAT1Q6PIZ9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TRAT1Q6PIZ9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRAT1Q6PIZ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms