Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CALCOCO2Q13137 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CALCOCO2Q13137 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
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