Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HERV-K104P61576 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HERV-K104P61576 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms