Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCNFP41002 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCNFP41002 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCNFP41002 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CCNFP41002 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CCNFP41002 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNFP41002 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNFP41002 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CCNFP41002 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CCNFP41002 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CCNFP41002 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNFP41002 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNFP41002 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CCNFP41002 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNFP41002 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNFP41002 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCNFP41002 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCNFP41002 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCNFP41002 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms