Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMO2P25791 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMO2P25791 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMO2P25791 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
LMO2P25791 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
LMO2P25791 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LMO2P25791 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LMO2P25791 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LMO2P25791 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LMO2P25791 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO2P25791 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO2P25791 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LMO2P25791 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LMO2P25791 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms