Protein–RNA interactions for Protein: P21796

VDAC1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDAC1P21796 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VDAC1P21796 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
VDAC1P21796 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms