Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
LDB2O43679 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
LDB2O43679 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
LDB2O43679 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LDB2O43679 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDB2O43679 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LDB2O43679 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LDB2O43679 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LDB2O43679 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDB2O43679 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDB2O43679 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LDB2O43679 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms