Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NPIPA5E9PKD4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NPIPA5E9PKD4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 153.7 ms