Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LRP12Q9Y561 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LRP12Q9Y561 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms