Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

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Length 871 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COPG2Q9UBF2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COPG2Q9UBF2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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