Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
IL1RAPQ9NPH3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
IL1RAPQ9NPH3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 409.2 ms