Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C3orf30Q96M34 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C3orf30Q96M34 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms