Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4I7

LIMS2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS2Q7Z4I7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIMS2Q7Z4I7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIMS2Q7Z4I7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms