Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN7

TOMM20L, TOMM20-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20LQ6UXN7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TOMM20LQ6UXN7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TOMM20LQ6UXN7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms