Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRD1

TIMM23B, Putative mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim23B, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM23BQ5SRD1 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TIMM23BQ5SRD1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TIMM23BQ5SRD1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms