Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SNCBQ16143 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNCBQ16143 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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