RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380094.9

ANKRD16-203, Transcript of ankyrin repeat domain 16, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene ANKRD16, Length 2,738 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD16-203ENST00000380094 NISCHQ9Y2I1 1504 aa40.25■■■■■ 4.03
ANKRD16-203ENST00000380094 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.58■■■■□ 3.13
ANKRD16-203ENST00000380094 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP34.11■■■■□ 3.05
ANKRD16-203ENST00000380094 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.1■■■■□ 3.05
ANKRD16-203ENST00000380094 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.97■■■■□ 3.03
ANKRD16-203ENST00000380094 CHIC1Q5VXU3 224 aa33.36■■■□□ 2.93
ANKRD16-203ENST00000380094 DCAF8L2P0C7V8 631 aa33.3■■■□□ 2.92
ANKRD16-203ENST00000380094 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.29■■■□□ 2.92
ANKRD16-203ENST00000380094 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa33.01■■■□□ 2.87
ANKRD16-203ENST00000380094 HRCP23327 699 aa32.94■■■□□ 2.86
ANKRD16-203ENST00000380094 PCGF6Q9BYE7 350 aa32.67■■■□□ 2.82
ANKRD16-203ENST00000380094 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa32.39■■■□□ 2.78
ANKRD16-203ENST00000380094 ABCC9O60706 1549 aa32.23■■■□□ 2.75
ANKRD16-203ENST00000380094 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.18■■■□□ 2.74
ANKRD16-203ENST00000380094 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.02■■■□□ 2.72
ANKRD16-203ENST00000380094 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP31.98■■■□□ 2.71
ANKRD16-203ENST00000380094 SCRIBQ14160 1630 aa31.94■■■□□ 2.7
ANKRD16-203ENST00000380094 TRIM41Q8WV44 630 aa31.75■■■□□ 2.67
ANKRD16-203ENST00000380094 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.68■■■□□ 2.66
ANKRD16-203ENST00000380094 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP31.5■■■□□ 2.63
ANKRD16-203ENST00000380094 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
ANKRD16-203ENST00000380094 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.39■■■□□ 2.62
ANKRD16-203ENST00000380094 NACADO15069 1562 aa31.37■■■□□ 2.61
ANKRD16-203ENST00000380094 MROH2BQ7Z745 1585 aa31.31■■■□□ 2.6
ANKRD16-203ENST00000380094 EHMT2Q96KQ7 1210 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD16-203ENST00000380094 WIZO95785 1651 aa31.12■■■□□ 2.57
ANKRD16-203ENST00000380094 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
ANKRD16-203ENST00000380094 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.87■■■□□ 2.53
ANKRD16-203ENST00000380094 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP30.65■■■□□ 2.5
ANKRD16-203ENST00000380094 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP30.62■■■□□ 2.49
ANKRD16-203ENST00000380094 ABCC8Q09428 1581 aa30.58■■■□□ 2.49
ANKRD16-203ENST00000380094 CCDC88BA6NC98 1476 aa30.58■■■□□ 2.49
ANKRD16-203ENST00000380094 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP30.57■■■□□ 2.48
ANKRD16-203ENST00000380094 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP30.56■■■□□ 2.48
ANKRD16-203ENST00000380094 SMARCA4P51532 1647 aa30.54■■■□□ 2.48
ANKRD16-203ENST00000380094 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.51■■■□□ 2.47
ANKRD16-203ENST00000380094 SMARCA2P51531 1590 aa30.5■■■□□ 2.47
ANKRD16-203ENST00000380094 CEP162Q5TB80 1403 aa30.43■■■□□ 2.46
ANKRD16-203ENST00000380094 SOGA1O94964 1423 aa30.41■■■□□ 2.46
ANKRD16-203ENST00000380094 TNIKQ9UKE5 1360 aa30.37■■■□□ 2.45
ANKRD16-203ENST00000380094 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP30.33■■■□□ 2.45
ANKRD16-203ENST00000380094 EEA1Q15075 1411 aa30.3■■■□□ 2.44
ANKRD16-203ENST00000380094 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
ANKRD16-203ENST00000380094 CSRNP3Q8WYN3 585 aa30.29■■■□□ 2.44
ANKRD16-203ENST00000380094 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.26■■■□□ 2.44
ANKRD16-203ENST00000380094 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.23■■■□□ 2.43
ANKRD16-203ENST00000380094 UBTFP17480 764 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
ANKRD16-203ENST00000380094 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ANKRD16-203ENST00000380094 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ANKRD16-203ENST00000380094 GOLGA3Q08378 1498 aa30.11■■■□□ 2.41
ANKRD16-203ENST00000380094 NEUROD1Q13562 356 aa30.09■■■□□ 2.41
ANKRD16-203ENST00000380094 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30■■■□□ 2.39
ANKRD16-203ENST00000380094 BICRAQ9NZM4 1560 aa29.95■■■□□ 2.39
ANKRD16-203ENST00000380094 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.95■■■□□ 2.38
ANKRD16-203ENST00000380094 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
ANKRD16-203ENST00000380094 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.9■■■□□ 2.38
ANKRD16-203ENST00000380094 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
ANKRD16-203ENST00000380094 SYNJ1O43426 1573 aa29.86■■■□□ 2.37
ANKRD16-203ENST00000380094 KIF21BO75037 1637 aa29.84■■■□□ 2.37
ANKRD16-203ENST00000380094 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa29.81■■■□□ 2.36
ANKRD16-203ENST00000380094 CLIP1P30622 1438 aa29.79■■■□□ 2.36
ANKRD16-203ENST00000380094 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP29.73■■■□□ 2.35
ANKRD16-203ENST00000380094 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD16-203ENST00000380094 VPS8Q8N3P4 1428 aa29.71■■■□□ 2.35
ANKRD16-203ENST00000380094 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
ANKRD16-203ENST00000380094 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa29.63■■■□□ 2.33
ANKRD16-203ENST00000380094 APLP2Q06481 763 aa29.59■■■□□ 2.33
ANKRD16-203ENST00000380094 MIER1Q8N108 512 aa29.48■■■□□ 2.31
ANKRD16-203ENST00000380094 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
ANKRD16-203ENST00000380094 TOP2BQ02880 1626 aa29.46■■■□□ 2.31
ANKRD16-203ENST00000380094 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
ANKRD16-203ENST00000380094 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD16-203ENST00000380094 PRXQ9BXM0 1461 aa29.32■■■□□ 2.28
ANKRD16-203ENST00000380094 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
ANKRD16-203ENST00000380094 ARAP1Q96P48 1450 aa29.26■■■□□ 2.27
ANKRD16-203ENST00000380094 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.26■■■□□ 2.27
ANKRD16-203ENST00000380094 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
ANKRD16-203ENST00000380094 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
ANKRD16-203ENST00000380094 CUX1P39880 1505 aa29.12■■■□□ 2.25
ANKRD16-203ENST00000380094 KIF27Q86VH2 1401 aa29.09■■■□□ 2.25
ANKRD16-203ENST00000380094 NCAPD3P42695 1498 aa29.08■■■□□ 2.25
ANKRD16-203ENST00000380094 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
ANKRD16-203ENST00000380094 HMGXB3Q12766 1538 aa29.06■■■□□ 2.24
ANKRD16-203ENST00000380094 CUX2O14529 1486 aa28.96■■■□□ 2.23
ANKRD16-203ENST00000380094 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa28.95■■■□□ 2.23
ANKRD16-203ENST00000380094 CFTRP13569 1480 aa28.95■■■□□ 2.22
ANKRD16-203ENST00000380094 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.94■■■□□ 2.22
ANKRD16-203ENST00000380094 MYT1Q01538 1121 aa28.86■■■□□ 2.21
ANKRD16-203ENST00000380094 ITGAEP38570 1179 aa28.8■■■□□ 2.2
ANKRD16-203ENST00000380094 IGF1RP08069 1367 aa28.77■■■□□ 2.2
ANKRD16-203ENST00000380094 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa28.72■■■□□ 2.19
ANKRD16-203ENST00000380094 MAP3K1Q13233 1512 aa28.69■■■□□ 2.18
ANKRD16-203ENST00000380094 TIAM1Q13009 1591 aa28.68■■■□□ 2.18
ANKRD16-203ENST00000380094 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.66■■■□□ 2.18
ANKRD16-203ENST00000380094 MAPKBP1O60336 1514 aa28.65■■■□□ 2.18
ANKRD16-203ENST00000380094 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa28.64■■■□□ 2.18
ANKRD16-203ENST00000380094 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.6■■■□□ 2.17
ANKRD16-203ENST00000380094 SETD5Q9C0A6 1442 aa28.6■■■□□ 2.17
ANKRD16-203ENST00000380094 PRDM2Q13029 1718 aa28.59■■■□□ 2.17
ANKRD16-203ENST00000380094 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms