Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TRAF3Q13114 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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TRAF3Q13114 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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TRAF3Q13114 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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TRAF3Q13114 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
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TRAF3Q13114 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TRAF3Q13114 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF3Q13114 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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TRAF3Q13114 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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TRAF3Q13114 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRAF3Q13114 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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TRAF3Q13114 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRAF3Q13114 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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