Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ABCE1P61221 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ABCE1P61221 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.5 ms