Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH5P33151 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH5P33151 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH5P33151 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH5P33151 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH5P33151 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH5P33151 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH5P33151 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH5P33151 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH5P33151 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH5P33151 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH5P33151 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH5P33151 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH5P33151 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH5P33151 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH5P33151 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH5P33151 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH5P33151 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CDH5P33151 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms