Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-13P0DP09 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGKV1-13P0DP09 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms