Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRNPP04156 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRNPP04156 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRNPP04156 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRNPP04156 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRNPP04156 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRNPP04156 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PRNPP04156 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRNPP04156 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRNPP04156 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRNPP04156 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRNPP04156 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRNPP04156 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRNPP04156 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRNPP04156 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRNPP04156 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRNPP04156 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRNPP04156 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRNPP04156 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms