Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
STX11O75558 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
STX11O75558 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
STX11O75558 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
STX11O75558 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
STX11O75558 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
STX11O75558 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
STX11O75558 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
STX11O75558 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms